液相色谱仪系统由储液器、泵、进样器、色谱柱、检测器、记录仪等几部分组成。液相色谱仪主要系统分为进样系统、输液系统、分离系统、检测系统和数据处理系统。主要来了解下这些系统的优点和特性。
    进样系统：一般采用隔膜注射进样器或高压进样间完成进样操作，进样量是恒定的。这对提高分析样品的重复性是有益的。
    输液系统：该系统包括高压泵、流动相贮存器和梯度仪三部分。流速可调且稳定，当高压流动相通过层析柱时，可降低样品在柱中的扩散效应，可加快其在柱中的移动速度，这对提高分辨率、回收样品、保持样品的生物活性等都是有利的。流动相贮存器和梯度仪，可使流动相随固定相和样品的性质而改变，包括改变洗脱液的极性、离子强度、PH值，或改用竞争性抑制剂或变性剂等。
   分离系统：该系统包括色谱柱、连接管和恒温器等。色谱柱由"优质不锈钢或厚壁玻璃管或钛合金等材料制成，固定相中的基质是由机械强度高的树脂或硅胶构成，它们都有惰性、多孔性和比表面积大的特点，加之其表面经过机械涂渍，或者用化学法偶联各种基因（如磷酸基、季胺基、羟甲基、苯基、氨基或各种长度碳链的烷基等）或配体的有机化合物。因此，这类固定相对结构不同的物质有良好的选择性。